テンプレート変更画面にて、新規登録する際に「設定ファイル(Config.yaml)のフォーマットが違います。」というメッセージが出ます。これはどういったことが原因になりますか？

Config.yaml はテンプレートアップロード時にドメイン名/キャンペーン（セミナー）IDを指定するための設定ファイルです。
Config.yamlに記載されているキャンペーン（セミナー）IDと、テンプレートをアップロードしたキャンペーン（セミナー）のキャンペーン（セミナー）IDが異なる場合、
「設定ファイル(Config.yaml)のフォーマットが違います。」とエラーが表示されます。

　　例：設定ファイル(Config.yaml)内に必要な空白(半角スペース)がない場合。
　　　 以下のように、該当キャンペーンの設定ファイル(Config.yaml)内を書き換えます。 
　　　＜変更前＞ 
　　　SeminarId:808
　　　↓ 
　　　＜変更後＞ 
　　　SeminarId: 808
　　　※「:（コロン）」と数字の間に半角スペースを入れます。

 変更が完了したら、再度テンプレートのアップロードを行ってください。
下記、デザインテンプレートカスタマイズマニュアルでも説明しております。